Сбор и утилизация медицинских отходов производятся так, чтобы исключить проникновение возможных инфекций в окружающую среду. Сбор отходов осуществляется в специально отведенные емкости, которые регулярно дезинфицируются. Отходы сортируются на стадии сбора в зависимости от класса опасности. Смешение отходов различных классов не допускается.

Утилизация биологических отходов осуществляется путем сжигания (инсинерации). Это не самый безопасный метод, приводящий к выбросу в атмосферу загрязнителей – диоксинов, но более совершенные технологии пока находятся в разработке. Отходы, содержащие хлор или тяжелые металлы, не подлежат сжиганию и утилизируются альтернативными методами. Пластмассовые отходы направляются на вторичную переработку.